Добрый день! Согласно нормативу вам нужен диаметр 110мм. На стену фланец 110мм.
Нет, дымоход не обязательно ставится поверх патрубка газовой колонки, это все посчитано производителем. У вас малая длина трассы, вам не обязателен герметик. Рекомендуем его лично вам только в декоративных целях и с целью уплотнения для личного успокоения)