Юссеф родился в 1828 году в северной части Ливана в семье христиан. Мальчик осиротел в раннем детстве, по арабским обычаям воспитывался в семье дяди. По достижении совершеннолетия (в 19 лет) стал семинаристом в духовном заведении при монастыре Аннайя. Через 2 года принял монашество под именем Шарбель, в память об антиохийском мученике II века. С теологическими дисциплинами его познакомил монах Аль-Хардини Кассаб, проповедник учения Марона, впоследствии признанный святым. Шарбель выделялся среди монашеской братии приверженностью к аскетизму, стремлением к духовному совершенствованию. Спустя 6 лет был возведен в сан священника. Святой еще при жизни прославился способностью излечивать болезни, ободрять павших духом. Молитвы, обращенные к Иисусу Христу и Пресвятой Богородице, и наложение рук помогали ему совершать чудеса. В 47 лет Шарбель удалился из монастыря и стал отшельником.
Он построил себе хижину из веток и звериных шкур на вершине горы, но предпочитал круглосуточно находиться на воздухе, проводя время в молитве, посте, труде, ухаживая за небольшим садом. Духовный подвиг длился 23 года. Святой скончался от воспаления легких накануне Рождества в 1898 году. Был похоронен на кладбище монастыря Аннайя.
День литургической памяти св. Шарбеля — 24 июля.