Здравствуйте, Андрей. Основная функция Гипердесмо защищать от воды которая попадает на мастику сверху, а не изнутри. У Вас, если мы правильно понимаем, задача залечить трубы из которых сочиться вода. Тут лучше подойдут другие материалы, например полиуретановый герметик Рабберфлекс.
В любом случае, можно попробовать, возможно получится решить проблему, самое главное перед нанесением мастики поверхность необходимо подготовить, очистить от ржавчины и просушить.