GT 350 дебютировал в кузове фастбэк со спортивным верхом первого поколения Ford Mustang в 1965 году. Выпускавшиеся до 1966 года, они были самыми маленькими и легкими из моделей GT 350. Работы на заводе Shelby American начались, когда завершалось производство двухместного спортивного автомобиля AC Cobra 289 на базе Ford AC Ace и начинался выпуск модификации 427 cu in. И AC, и Shelby Mustang используют эмблему Cobra, схожую схему окраски и дополнительные крышки клапанов "Cobra", устанавливаемые на многих GT350, которые были частью маркетинговой кампании Shelby, а также одним из его знаковых символов. Все автомобили 1965-66 годов выпуска оснащались двигателем V8 Windsor объемом 289 куб.см (4,7 л) HiPo K-Code мощностью 271 л.с. (202 кВт; 275 л.с.), модифицированным большим 4-цилиндровым карбюратором Holley 725 CFM, который выдавал 306 л.с. (310 л.с.; 228 кВт) при 6000 оборотах в минуту и 329 фунт/фут. (446 Нм крутящего момента при 4200 оборотах в минуту.[3][4] В маркетинговой литературе этот двигатель называют "Cobra hi-riser" из-за его высокого впускного коллектора. Начиная с серийного Mustang с 4-ступенчатой механической коробкой передач и 9-дюймовой задней осью, автомобили поставлялись в Shelby American, где они получили высокие коллекторы, трехгранные коллекторы, а также более крупные задние барабанные тормоза Ford Galaxie с металлическими накладками и передние тормоза Kelsey-Hayes. дисковые тормоза.