Добрый день.
Соевые наполнитель изготавливают из растительного сырья. Древесные из сосновых пород деревьев.
И соевые и древесные обладают аналогичными свойствами по впитываемости, плотности комка, удержанию запаха. И тот и другой можно смывать в унитаз.
Отличие по стоимости, а так же растительные наполнители считаются более гипоаллергенными.