Помпы служат для перемешивания воды и создания течения, необходимого для многих рыб и практически для всех видов морских кораллов. Также помпы используют для предотвращения образования стоячей воды, равномерному распределению температуры воды в аквариуме, а также для растворения морской соли, для подачи воды в фильтры и ультрафиолетовые стерилизаторы. Широко применяются помпы для перекачивания жидкости.